La Reserva Maquipucuna está ubicada en las estribaciones occidentales de los Andes ecuatorianos.  Es fácilmente accesible en vehículo, por camino pavimentado y lastrado; su región sur se encuentra a cuarenta y cinco minutos de Quito, mientras que el Lodge está a dos horas de la capital.

Fue declarada legalmente un Parque Protector Privado en 1989, para proteger uno de los últimos remanentes de bosque nublado en el noroccidente ecuatoriano.   Originalmente fueron compradas cerca de 3.000 hectáreas de bosque primario, y mediante adquisiciones posteriores de terrenos adyacentes, la Reserva tiene al momento aproximadamente 5.000 hectáreas, de las cuáles cerca del 80% de la Reserva es bosque nublado montano primario.   Adicionalmente, la Fundación Maquipucuna fue la promotora en la creación de un Bosque Protector de 18.000 hectáreas, el cual está alrededor de la Reserva y sirve de zona de amortiguamiento.

La Reserva Maquipucuna es parte de la bioregión fitogeográfica del Chocó, y por lo tanto en la Reserva se pueden encontrar elementos biológicos andinos y del Chocó.  La constante humedad en este ambiente montano provee las condiciones ideales para epífitas, y debido a la riqueza de su vegetación, estos bosques nublados exceden en número de variedades de plantas a los bosques  de tierras bajas.

Existe una amplia red de senderos de diversa dificultad, altura y extensión.  Se dispone de un Lodge que acomoda a eco-turistas, una Estación Científica que recibe a investigadores, estudiantes y voluntarios, e instalaciones de laboratorio para ejecutar investigaciones.  Adicionalmente existen pequeñas casas, al interior de la Reserva, desde donde los investigadores pueden trabajar